Comme dans les versions précédentes de Pokémon, les versions Diamant et Perle possèdent une Tour de Combat, utilisée pour faire combattre vos Pokémon contre des adversaires
à l'IA plus élevée que les autres dresseurs face auxquels vous aurez eu affaire. Cette Tour de Combat a subi quelques changements :
Tout d'abord, il n'y a plus de niveaux différents, la Tour de Combat se limitant au niveau 50. Ne voyez pas cela comme une restriction, car si vos Pokémon dépassent ce niveau, ils seront
redescendus au niveau 50 le temps de participer. Cela permet ainsi d'utiliser toute son équipe, sans avoir à se préoccuper de leurs niveaux actuels.

Comme dans Émeraude, combattre dans la Tour de Combat vous permettra de glaner des
Points de Combat, utilisables pour de nombreuses choses dans le bâtiment au sud de la Tour de Combat. Néanmoins,
18 Pokémon sont interdits d'utilisation dans la tour. Les voici : Mewtwo, Mew, Lugia, Ho-Oh, Celebi, Kyogre, Groudon, Rayquaza, Jirachi, Deoxys, Dialga, Palkia, Giratina, Manaphy, Phione, Darkrai, Shaymin et Arceus.
À l'intérieur de la Tour de Combat, il y a trois entrées :
À droite se trouve la zone Wi-Fi, qui vous permet d'envoyer une équipe sur le net ou d'en télécharger une, histoire de l'affronter dans la Tour.
La porte centrale : vous aurez affaire aux
combats normaux. Ils peuvent aussi bien être en simple ou en double, histoire de tester votre équipe contre les meilleurs joueurs dirigés par la console. Plus vous gagnez de parties d'affilée, plus ils sont difficiles à battre. De plus, comme sur Émeraude, vous aurez à
battre le Meneur de la Tour à plusieurs reprises. Ce Meneur est l'un des plus puissants dresseurs et vous aurez besoin d'une bonne dose de stratégie pour le battre, ce qui, si vous y parvenez, vous rapportera
20 Points de Combat. Il apparaîtra à votre
21ème combat d'affilée, où il utilisera Dracolosse, Milobellus et Rhinastoc, et à votre
49e combat de suite, où il sortira Heatran, Regigigas et Cresselia.
| 21ème Combat |  |  |  |  |
| Meneur | Dracolosse | Milobellus | Rhinastoc |
| 49ème Combat |  |  |  |  |
| Meneur | Heatran | Regigigas | Cresselia |
La porte à gauche vous conduira aux
combats en Multi, où vous pourrez
vous allier avec un ami via la fonction Sans Fil de la DS et traverser la Tour de Combat ensemble. Mais si vous n'avez pas d'ami à portée de main, il vous reste un mode solo où vous pourrez
vous allier avec des dresseurs rencontrés pendant le jeu, pour peu que vous les ayez déjà croisés. Vous arriverez dans une pièce avec cinq dresseurs avec qui vous pourrez discuter, ce qui vous permettra d'en choisir un comme allié. Bien entendu, ils ne possèdent pas uniquement les Pokémon qu'ils avaient lors de votre rencontre ; leur équipe est assez variée, et certains ont même plusieurs sets de capacités.

 | Équipes de Sara de la Forêt Vestigion |
 |  |  |  |  |  |
| Ronflex | Mentali | Noctali | Porygon2 | Leuphorie | Milobellus |
 |  |  |  |  |
| Latias | Latios | Tritosor | Porygon-Z | Cresselia |
 | Équipes de Maïté de la Grotte Revêche |
 |  |  |  |  |  |
| Alakazam | Ectoplasma | Électhor | Mentali | Gardevoir | Latios |
 |  |  |  |  |  |
| Roserade | Magnézone | Maganon | Togekiss | Givrali | Porygon-Z |
 | Armand de l'Île de Fer |
 |  |  |  |  |
| Tartard | Mackogneur | Rhinoféros | Léviator | Ursaring |
 |  |  |  |  |
| Tyranocif | Braségali | Chapignon | Monaflèmit | Hariyama |
 |  |  |  |  |
| Charmina | Absol | Drattak | Métalosse | Charkos |
 |  |  |  |  |
| Lucario | Coatox | Rhinastoc | Mammochon | Regigigas |
 | Viviane de la Route Victoire |
 |  |  |  |  |
| Triopikeur | Électrode | Staross | Ptéra | Nostenfer |
 |  |  |  |
| Jungko | Hélédelle | Ninjask | Dimoret |
 | Cornil du Mont Abrupt |
 |  |  |  |  |
| Noctali | Foretress | Steelix | Caratroc | Airmure |
 |  |  |  |  |
| Regirock | Regice | Registeel | Bastiodon | Rhinastoc |
 |  |  |
| Tarinorme | Noctunoir | Cresselia |
Par
Izual