Pour certains, ce point a toujours été une arnaque de la part de Nintendo, dans les faits, c'est ce qui a favorisé les interactions entre les joueurs et a d'une certaine manière fait tout l'intérêt de la saga... Dans tous les cas, les versions Pokémon sont toujours sorties en duo, et pour justifier cette dualité, les développeurs ont mis en place des Pokémon exclusifs, c'est-à-dire des Pokémon que vous pouvez attraper dans une version, mais pas dans la version complémentaire, ce qui n'est pas une mauvaise chose puisque ça incite les joueurs à en rencontrer d'autres afin de pouvoir terminer le jeu sans utiliser d'artifices. Et bien évidemment, les versions HeartGold et SoulSilver ne sauraient faire exception à la règle, bien que dans les faits, l'utilisation de la Global Trade Station contribue largement à la "disparition" de cette exclusivité, encore faut-il que vous sachiez comment faire fonctionner la Connexion Wi-Fi Nintendo, ce qui n'est pas toujours gagné chez certains.
| Pokémon exclusifs à la version HeartGold | Pokémon exclusifs à la version SoulSilver | ||
| Nom | Image | Nom | Image |
| Ferosinge |  | Goupix |  |
| Colossinge |  | Feunard |  |
| Caninos |  | Miaouss |  |
| Arcanin |  | Persian |  |
| Mimigal |  | Coxy |  |
| Migalos |  | Coxyclaque |  |
| Scorplane |  | Teddiursa |  |
| Demanta |  | Ursaring |  |
| Phanpy |  | Cadoizo |  |
| Donphan |  | Airmure |  |
| Tenefix |  | Mysdibule |  |
| Balbuto |  | Gloupti |  |
| Kaorine |  | Avaltout |  |
| Kyogre |  | Groudon |  |
| Babimanta |  | ||
| Scorvol |  | ||
Rédigé par Phénix
